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CyteSeer ®自動視頻分析軟件

 更新時間:2020-12-08 點(diǎn)擊量:1469

 

CyteSeer ®自動視頻分析軟件

valasciences. CyteSeer®的胞質(zhì)ROI實(shí)例

CyteSeer通過整理由專有的速度優(yōu)化算法得出的數(shù)據(jù)來報(bào)告每種藥物的效果,這些算法對每個細(xì)胞進(jìn)行分段和識別,然后提取并參數(shù)化視頻中每個細(xì)胞的每個瞬態(tài)的形狀。

KIC + CyteSeer生成豐富的,可擴(kuò)展的數(shù)據(jù)集,這些數(shù)據(jù)集充分表征了異質(zhì)細(xì)胞的動力學(xué)特性,從而能夠:

  1. 靈敏度和可預(yù)測性,
  2. 人混合細(xì)胞/類器官疾病模型的分析,以及
  3. 細(xì)胞間健康,例如突觸,通訊。

瞬態(tài)參數(shù)化:心肌細(xì)胞圖

Cyteseer心肌細(xì)胞動作電位圖

單線提取
視頻,從單個角度觀察668個hiPSC心肌細(xì)胞(用1.0 uM硝苯地平處理)的6,984個單獨(dú)動作電位,證明了動力學(xué)異質(zhì)性,這種異質(zhì)性通常隨著候選藥物治療,毒性和模型(例如遺傳)疾病而增加。(以30 fps顯示。)

心肌細(xì)胞動作電位參數(shù)化

CyteSeer參數(shù)化每個瞬態(tài)
CyteSeer生成每個瞬態(tài)的詳細(xì)定量特征,從而能夠與已知的人類基準(zhǔn)(健康或患病)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)比較。

CyteSeer ®視頻分割和小區(qū)標(biāo)識
自動識別每個視頻捕獲的每個小區(qū),并且提取和措施單細(xì)胞跡線和單個瞬變。

CyteSeer大數(shù)據(jù)
CyteSeer可以捕獲,簡化和報(bào)告復(fù)雜數(shù)據(jù):每天從7,000口井中提取77 TB視頻中3千萬個細(xì)胞中的40億個參數(shù):

  • 每個單元3-40個瞬態(tài)中的每個瞬態(tài)都有30個參數(shù)(走線上+10)
  • 完整的實(shí)時/固定小區(qū)HCS

CyteSeer和Vala的專業(yè)知識:
通過Vala團(tuán)隊(duì)解釋CyteSeer的大量數(shù)據(jù)輸出,結(jié)果是對候選藥物如何影響細(xì)胞(功效或副作用)和預(yù)測)理解,從而可以有效地對候選候選藥物進(jìn)行排名并實(shí)現(xiàn):

  • 人類臨床結(jié)果的高可預(yù)測性(與動物研究相比)
  • 在線索發(fā)現(xiàn)中早對藥物進(jìn)行佳配置(排序)(結(jié)合高通量和低成本)